请计算2011年1月1日发行的面值100元的中央银行票据，年贴现率为3.5%，在2011年6月30日的理论价格。

根据题目给出的信息，我们知道该中央银行票据的面值为100元，年贴现率为3.5%，我们可以使用现值公式来计算该票据的理论价格。由于票据的期限是半年（从2011年1月1日到2011年6月30日），所以时间因子应为0.5。因此，理论价格的公式为：理论价格 = 面值 / （1 + 年贴现率）^ 时间因子。代入已知数值计算得：理论价格 = 100 / （1 + 3.5%）^ 0.5 ≈ 98.3元。因此，选项B是正确的答案。