在发生下列（）情形时，证券公司应当进行合规事项专项检查。
Ⅰ 公司发生违法违规行为的
Ⅱ 公司监事会认为必要的
Ⅲ 监管部门或自律组织要求的
Ⅳ 公司业务部门认为需要的

根据相关规定，证券公司在以下情形应当进行合规事项专项检查：

1. 公司发生违法违规行为的（Ⅰ项正确）；
2. 公司董事会、监事会认为必要的（Ⅱ项正确）；
3. 监管部门或自律组织要求的（Ⅲ项正确）；
4. 其他有必要进行专项检查的情形。

因此，选项C（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）是正确的。公司部门认为需要并非必须的条件，所以不包括在选项中。