下列选项中，注册会计师在制定存货监盘计划时不应当进行的是（  ）。

在制定存货监盘计划时，注册会计师需要注意以下几点：

A选项：将被审计单位提交给其他公司代为保管的存货纳入监盘范围。这是正确的，因为这些存货也是被审计单位资产的一部分，需要进行盘点和审计。

B选项：向保管被审计单位存货的公司函证被审计单位的委托保管的存货情况。这也是正确的，注册会计师需要通过函证等方式确认存货的存在和状况。

C选项：直接利用被审计单位的账簿记录确认交由其他公司保管的存货的账面价值。这是不正确的。注册会计师不能仅依赖被审计单位的账簿记录来确认第三方保管的存货的账面价值。为了确认这些存货的账面价值，注册会计师应该实施函证、监盘或利用其他注册会计师的工作，以获取充分、适当的审计证据。

D选项：由于交由其他公司保管的存货占流动资产的比例较大，注册会计师考虑实施存货监盘或利用其他注册会计师的工作。这是正确的，特别是对于占比重大的存货，更需要加强审计程序，以确保其准确性和完整性。

因此，正确答案是C：直接利用被审计单位的账簿记录确认交由其他公司保管的存货的账面价值。