关于企业深层技术改造的表现，以下哪些选项是正确的？

深层技术改造主要涉及到企业内部的深层次变革，表现为生产方式、管理方法和市场开拓等方面的革新。因此，选项中与企业深层技术改造表现相关的有：生产方式的革新（A）、新管理办法的实施（D）和新市场的开拓（E）。而新厂房的建造（B）和新技术的应用（C）虽然可能与企业技术改进有关，但并不特定于深层技术改造的表现。因此，正确答案是A、D、E。