关于甲公司的子公司与其股东之间的交易或事项，下列哪些情况会影响甲公司的所有者权益总额变动？

关于甲公司的子公司与其股东之间的交易或事项，影响甲公司的所有者权益总额变动的有：

A. 2月3日，甲公司向其控股60%的子公司(乙公司)捐赠货币资金3000万元。这个交易会导致甲公司的资产减少（现金减少），同时没有任何相应的增加项来抵消，因此会导致所有者权益总额减少。

D. 12月31日，甲公司的子公司(丁公司)持有的作为以公允价值计量且其变动计入其他综合收益的金融资产的股票投资公允价值相对年初下降1200万元。这个公允价值变动会影响丁公司的所有者权益，由于变动计入了其他综合收益，也会间接影响甲公司的所有者权益总额。

B选项和C选项中的交易，如资本公积转增资本和派发股票股利，都是所有者权益内部的变化，不会影响到所有者权益总额。因此，正确答案是A和D。