关于注册会计师对审计工作底稿的变动，以下哪些做法是正确的？

在归档期间，注册会计师可以对审计工作底稿进行必要的变动，包括删除或废弃被取代的审计工作底稿（选项A）以及记录在审计报告日前获取的、与项目组相关成员进行讨论并达成一致意见的审计证据（选项B）。同时，如果由于实施追加的审计程序而需要修改审计工作底稿，注册会计师应当记录修改的理由、时间和人员，以及复核的时间和人员（选项D）。因此，正确的做法包括A、B和D。选项C中的做法是不正确的，因为归档期间收到的询证函回函不应替代审计报告日前已实施的替代程序审计工作底稿。