当管理层未能实施恰当控制以应对特别风险时，注册会计师应采取哪些措施？

如果管理层未能实施控制以恰当应对特别风险，注册会计师应当执行以下步骤：

1. 评价是否构成控制缺陷，这是非常重要的，因为这有助于确定是否存在内部控制问题。
2. 认为内部控制存在值得关注的缺陷，因为管理层未能实施适当的控制来应对特别风险。
3. 考虑对风险评估的影响，因为内部控制的缺陷可能会影响注册会计师对财务报表的风险评估。
4. 就此类事项与治理层沟通，以确保他们了解内部控制的问题并采取相应的措施。

因此，选项A“评价是否构成控制缺陷”，选项B“认为内部控制存在值得关注的缺陷”，选项C“考虑对风险评估的影响”，选项D“就此类事项与治理层沟通”都是正确的选择。参照给出的参考答案，正确答案为BCD。