关于不得作为医疗机构制剂申报的情形，以下哪些选项是正确的？

根据医疗机构制剂申报的相关规定，不得作为医疗机构制剂申报的情形包括：市场上已有供应的品种、含有未经国家药品监督管理部门批准的活性成分的品种、中药注射剂以及医疗用毒性药品、放射性药品。因此，选项A、B、C和D都是正确的。其他如除变态反应原外的生物制品、中药和化学药组成的复方制剂等也是不得作为医疗机构制剂申报的情形，但在本题中没有提到，所以只选ABCD。