信息系统工程项目的质量控制体系以(32)为主体，在项目开始实施之前由(32)主导建立，(32)对组织结构、质量目标、自测制度等要素进行检查。

在信息系统工程项目中，质量控制体系的主体是承建单位的质量保证体系。这意味着承建单位在项目实施过程中要承担主要的质量控制责任。项目开始实施之前，这个质量控制体系应由承建单位建立。而监理单位则负责对项目的组织结构、工序管理、质量目标以及自测制度等进行检查，以确保项目的质量得到保障。因此，正确答案是D：承建单位、承建单位、监理单位。