项目执行过程中，当出现实际进度与计划进度严重偏离时，监理必须提请建设单位并要求承建单位处理，制定必要的整改措施。这种控制通常以（58）为主要检查对象。

题干中提到，当出现实际进度与计划进度严重偏离时，监理的主要检查对象通常是承建单位的标志性阶段任务，也就是里程碑任务的完成情况。这是因为里程碑任务是项目中的重要节点，其完成情况能够直观地反映项目的实际进度。选项A“里程碑任务完成”符合这一描述。而选项B“项目初验报告”、选项C“项目会议纪要”和选项D“项目变更实施计划”虽然都是项目管理中的一部分，但它们并不是此时监理检查的主要对象。因此，答案为A。