采用流程图法进行风险识别的核心在于按建设工程实施全过程的内在逻辑关系制作流程图，针对该流程图中的哪些内容进行调查和分析？

采用流程图法进行风险识别时，关键步骤是按建设工程实施全过程内在逻辑关系制成流程图，然后针对流程图中的关键环节和薄弱环节进行调查和分析，以发现潜在的风险威胁并分析风险可能造成的损失和影响。因此，本题的正确答案是D。